Sciospec EIT16 - 16通道EIT设备-是一个全功能的高带宽电阻抗断层成像系统,用于雄心勃勃的研究应用。利用Sciospec EIT系统(如EIT16)生成的EIT数据以及相应的Sciospec软件可以在基于Matlab的自由软件EIDORS中导入、处理和可视化。Sciospec提供了适当的Matlab代码示例和指导,以帮助您开始使用这个集合。本应用说明演示了如何导入和执行EIDORS图像重建使用Matlab代码提供的Sciospec。使用Sciospec EIT16和相应的Sciospec软件在标准的phantom实验中生成了一些样本数据。
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用Sciospec EIT-16电阻抗谱成像系统测量与可视化数据处理
从研究目标仪器如EIT16到完全定制的OEM产品,用于生物分析、医疗和工业应用,ScISPec为电阻抗断层扫描成像提供高度专业化的解决方案。灵活的通道配置,频率扫描模式,可扩展性高达数百个通道和广泛的扩展选项,通过传感器适配器,附加模块和更多,使Sciospec EIT系统适合多种雄心勃勃的应用。EIDORS (Electrical Impedance Tomography and Diffuse optical tomography Reconstruction Software)是一款用于EIT图像重建和处理的免费软件。EIDORS基于MATLAB,但也与免费开源的OCTave协同工作,得到了学术界EIT专家的广泛使用和支持。Sciospec EIT16 - 16通道EIT设备-是一个全功能的高带宽电阻抗断层成像系统,用于雄心勃勃的研究应用。利用Sciospec EIT系统(如EIT16)生成的EIT数据以及相应的Sciospec软件可以在基于Matlab的自由软件EIDORS中导入、处理和可视化。Sciospec提供了适当的Matlab代码示例和指导,以帮助您开始使用这个集合。本应用说明演示了如何导入和执行EIDORS图像重建使用Matlab代码提供的Sciospec。使用Sciospec EIT16和相应的Sciospec软件在标准的phantom实验中生成了一些样本数据。
生成测量数据
实施EIT测量的必要设备:
Sciospec EIT系统,例如16通道EIT系统(EIT16)。这包括:
EIT16设备
Sciospec软件
16根测量电缆(16根标准Sciospec MCX-to-banana-plug电缆和16个鳄鱼夹)
电源
USB电缆
Sciospec标准透明水箱
PC
水
目标物,例如中空玻璃筒(绝缘物体)
Sciospec标准的EIT透明水箱直径为20厘米,高度为15厘米,在水箱周围的一个水平面上设置了16个不锈钢电极。在模型中装满了2.5升的自来水。注:可通过使用去离子水和添加所需数量的NaCl或其他盐得到精确的盐含量的水。每个电极逆时针连接到Sciospec EIT16设备,使用标准Sciospec MCX-to-banana-plug电缆组,如图1所示。
在Sciospec软件中设置测量参数,如图3所示:
频率:1 point at 100kHz
幅值:10mA
电流源:DC
帧率:30
首先,在没有任何物体的情况下对装满自来水的模型进行测量,以获得“参考”数据。通过添加一个绝缘性物体(在本例中:直径3厘米的中空玻璃圆柱体)并将其移动到水箱内部,产生了“异常”数据。通过选择数据集并按下save按钮,可以轻松导出数据集,如图4所示。文件存储在选定的目录中,包括一个数字,文件扩展名为'.eit'。
在EIDORS中导入、处理和可视化数据
EIDORS (Electrical Impedance Tomography and Diffuse Optical Tomography Reconstruction Software)是一款基于Matlab的EIT数据处理可视化软件。这一部分展示了如何使用Matlab代码导入'。使用Sciospec软件生成的文件,并处理和可视化一些样本数据集。Sciospec根据请求提供了重做应用程序说明中所示的过程所需的所有文件。
所提供的文件夹中包含三个Matlab文件:
“fnc_read_Sciospec.m”
“func_ConvertSciospecToEIT.m”,
“Main_SciospecData_with_eidors.m”。
使用提供的Matlab代码和样本数据集导入、处理和可视化EIT数据的指南:
1.开始Matlab
2.打开Main_SciospecData_with_eidors.m'
3.启动EIDORS时,在代码的第2行中输入EIDORS的适当文件路径
4.在第7行和第19行中配置“Reference”和“Anomaly”数据的测量路径5.
运行Matlab脚本(菜单栏中的“run”按钮)
注意:如果在这个应用程序中使用的数据集与示例数据集不同,注意:在步骤4中配置整个代码(如图7所示的代码片段)到您的数据集。
运行Matlab脚本后,将显示从第1帧到第180帧的时差EIT成像。差分成像的第36帧如图8所示。成像显示了彩色编码的电导率随时间的变化。与参考盐水相比,白色区域的电导率没有变化。蓝色表示其电导率相对于参考点下降的区域。在这个例子中,使用了一个中空玻璃物体,因此显示为蓝色。与参考数据相比,电导率增加的区域以红色显示。
结论
在本应用说明中,介绍了使用Sciospec EIT系统(如EIT16)生成测量数据,在EIDORS中导入、处理和可视化数据的整个过程。Sciospec提供的Matlab代码也可以用于导入其他 '.eit数据集。
参考
•//eidors3d.sourceforge.net/index.shtml
•Uses and abuses of EIDORS: An extensible software base for EIT (Andy Adler and William R B Lionheart, Physiol. Meas., 27:S25-S42, 2006)
•Sciospec EIT system manual
•//www.sciospec.de/references/#appnote
•Sciospec EIT16
关于生产商:
Sciospec专注于电阻抗谱、阻抗断层成像和其他电化学/分析技术的解决方案。主要应用于生物分析,生物传感器,材料科学和过程控
制。从基于多通道生物芯片阅读器的小规模生物芯片解决方案,到用于全自动工业过程控制或药理学测试的高含量筛选的大规模多通道
解决方案,可扩展性是我们DNA中的一部分。以OEM模块形式存在的Scispec技术是无数生物分析和医疗应用产品的核心。与此同
时,我们高度可定制的解决方案使交钥匙研究成为可能,为下一代半导体制造提供动力,并使自动化组件测试应用的可扩展性达到
新的水平。
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